新資訊架構協助流行病分析和疫苗篩選

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【大紀元12月5日報導】(中央社記者韋樞台北五日電)流行性疾病種類和發生機率快速攀升,病毒變種速度很快,病毒專家每年都會預測當年會流行何種流感病毒,以決定製造新的疫苗。美商資訊大廠和陽明大學合作,提供SOA(服務資訊架構)當成生物資訊研發平台,讓研發人員快速建立病毒演化模式,提昇疫苗生產和疾病防治的功能。

目前流感疫苗產生過程是由世界衛生組織 (WHO)每年春天邀集病毒專家,根據過去病毒演化的趨勢和各地病例資訊來研判當年可能會流行何種流行性感冒的病毒,以便製造新的疫苗供人類在冬天來臨前施打。

不過病毒或細菌為適應宿主環境,會不斷的藉由基因突變和環境篩選自行演化,以適應新的宿主和環境;也由於流行性感冒病毒突變的速度很快,且各地區在不同時間點流行的病毒株也不盡相同,若能分析並建立區域性病毒的演化模式,將有助於有效疫苗的生產和疾病防治。

為了加速病毒的研判,美商IBM公司提出「聯合大學研究計畫 (Shared University Research, SUR)」,宣佈啟動「流行性疾病分析系統與疫苗用病毒株篩選」計畫。這個計畫就是要藉SOA架構的彈性與重組,將傳統建立病毒模式逐個的套入系統測試,改成以如同積木可重組的SOA架構中分析,原本需要一個月才能分析完畢模式的速度大幅縮短成一週。

台灣IBM公司生物資訊研發中心高級工程師呂政欽表示,SOA具彈性、擴充性與重複利用的特性,與IBM所贊助的軟硬體設備、技術協助與顧問諮詢服務,採用新的分析流程與架構平台,有助穩定病毒資料庫的系統,建立友善的使用者介面,大幅縮短流感資訊處理時間;未來更可隨需彈性修改流程,擴充應用於新增的分析工作,以提供其他相關流行性疾病的研究與預測。 陽明大學系統與合成生物學研究中心主任楊永正說,禽流感過去是候鳥接觸家禽後傳染病毒,家禽與豬接觸後,病毒跳到豬身上發生突變而傳染給養豬戶;不過最近的新型流感病毒根本略過在豬身上的交換,直接由家禽跳到人身上,造成新的流感,這種病例還不多,但病毒突變的幅度非常大,速度更快。

楊永正指出,以目前分析病毒模式的速度來看,可能根本趕不上病毒突變的速度,所以需要更強大的資訊平台節省流程開發時間,並重複運用與累積工具,未來還可因應不同的研究或分析需求,調整與擴充系統功能,對疫苗的研發有非常大的幫助。

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