北美殖民地的形勢卻是另一番景象。1768年，麻薩諸塞州議會聯絡弗吉尼亞議會，共同發出巡迴信件，呼籲殖民地各州團結禦侮。於是英國政府又頒布了一次唐森德條例：解散麻薩諸塞議會。1768—1769年冬，英國內閣還準備將殖民地領導反抗的強硬分子拘往英國，以亨利八世時的叛國罪判刑。殖民地人民憤怒了。
波士頓的商人率先起來，領導了全國性的抵制英貨運動。殖民地人民組織起來，用武力抵抗英國稅吏的搜查和壓迫。這次空前廣泛的反英運動，不僅抵制英貨，而且要求廢止唐森德條例。在鬥爭中，華盛頓把1769年的弗吉尼亞決議引進下院，決議由喬治•梅森起草，華盛預和托馬斯•傑斐遜都在決議上籤了名。傑斐遜那年26歲。抵制英貨的結果，是英國向殖民地輸出的貿易總額劇減。英國政府被迫廢除了唐森德條例。
但是雙方的矛盾並未消除，也無法消除。這是一種利害衝突：英國統治者為了發展本國的資本主義工商業，不惜用各種手段打擊、摧殘北美殖民地的工商業。這一次，英國的商人、廠主甚至工匠都站在他們的政府一邊。而殖民地人民尚未準備好迎接不可避免的越來越艱巨的鬥爭：他們還沒有統一，他們中的大多數人還願意效忠於英王。就在這時，英國當局對反抗的殖民地人民進行了一次血腥的鎮壓。這就是「波士頓慘案」（又稱「波士頓屠殺」）——英國駐軍屠殺波士頓人民群眾的流血事件。
從1765年英國頒布了駐營條例以後，一直有兩團正規軍駐防波士頓。這些駐在北美殖民地的英國士兵，完全蔑視殖民地的法令，常常胡作非為，酗酒鬧事，殖民地人民和英國駐軍的衝突從未間斷，尤其是1770年以來，2月，英國稅吏開槍殺害一名兒童，引起3月2日波士頓工人和英國駐軍第20團發生正面衝突。3月5日，波士頓又發生了英軍淩辱學徒的事件，殖民地人民憤怒地聚集到駐紮英軍的英王街上，對那名淩辱學徒的英軍投擲雪球以洩憤。英軍指揮官普利斯頓上尉下令開槍，打死了5名群眾，全部是水手、工人和學徒。
這一事件被稱為「波士頓慘案」。
這時的富蘭克林繼1768年被喬治亞、1769年被紐澤西委任為代理之後，於1769年12月被委託為麻薩諸塞的代理人。1月17日，他為他的新使命謁見英國殖民地事務大臣希爾斯伯羅。但希爾斯伯羅在麻薩諸塞事務上表現出的無知和偏見，使富蘭克林轉身離去的時候說了幾句尖刻的告別辭：「請公爵大人原諒我佔用了您那麼多的時間。我感到一個代理人眼下對任何一個殖民地都沒有什麼用處。所以我不會再給您找什麼麻煩了。」這幾句話惹惱了希爾斯伯羅，他後來對其他人說，這些話「等於當面告訴他，在他的任期內，殖民地休想得到好處和公正」。
作為麻薩諸塞的代理人，富蘭克林堅決地站在這塊殖民地一邊，為北美洲殖民地的利益奮鬥。在賓夕法尼亞，甚至當他領導著州議會的時候，他還時而站在議會和州長之間從緊急狀況的需要出發作些調解。但是，他在波士頓的主要聯繫人托馬斯•庫辛和塞繆爾•庫柏一向是反英的，富蘭克林和他們站在一起。富蘭克林在他1771年5月15日給通訊委員會的信中預言了壓迫的加劇和革命的發生都將是難以避免的。他寫道：
「我想人們可以清楚地看到，在國會的法案向美洲實行的關稅體系中，播下了兩個國度徹底決裂的種子，儘管那一事件可能距離我們還相當遙遠」。「人民越是不滿，更苛刻的措施越被認為需要採取；嚴厲的懲罰被用來進行恐嚇；權利被剝奪；於是，更大的軍事力量被用於保證執行措施；費用將會增多；由於費用被以為是正當的，便引起進一步的搾取，要人民支付它；那麼一來，英國國家和政府將變得可憎，而臣服於它必將變得難以繼續；戰爭開始，而這一流血的鬥爭不是在對美洲的絕對奴役中結束，就是以英國因失去殖民地而遭受破壞而告終。從美洲增長著的力量和國土之大來看，後一種結果最有可能。……」
在此，富蘭克林不僅預測了美英之間矛盾衝突的發展，而且也預言了其結果：勝利屬於殖民地人民。但是他始終認為美英決裂將是一場災難。他說：「我不敢妄稱有預言家的天分，歷史表明，由於這樣的事態發展道路，偉大的帝國曾經化為灰燼；最近的我們有如此之多的理由去抱怨的政府措施表明，我們正處於同樣的進程中，表明假如雙方不表現出更多的明智和謹慎，我們可能會得到同樣的下場。」
正因為此，他在英國期間，竭盡一切可能，力圖阻止雙方走向這場「災難」。對殖民地人民，他雖然認為有一切理由反抗，但希望反抗形式不要過於激烈；對英國當局，他把所有的鎮壓措施歸咎於當權者的頑固和不明智，寄望於由較好的大臣執政。他心目中關於英、美統一在一個強大帝國內的理想還沒有泯滅。
與此同時，他曾為之奔波忙碌的「西部領土計劃」仍在進行。1769年初，該計劃的發起人之一塞繆爾•沃頓來到倫敦，企圖促進計劃的實施。6 月，他向商務部提出申請，要求得到1768年11月英國從同「六族」印第安人締結的「斯坦威克斯條約」中得到的大片印第安人土地中的250萬英畝土地。在希爾斯伯羅的慫恿下，這一請求後來改變為2000萬英畝。由於公司願意支付英國政府同印第安人談判以締結「斯坦威克斯條約」的一切費用，並在將來為得到的土地支付一筆可觀的費用，他們的申請於1770年初得到財政部同意。
然而，曾經假想支持該計劃的希爾斯伯羅卻一直拖延不辦。到1771年4月，他終於明確提出了反對意見，使大俄亥俄公司的計劃有可能擱淺。而這時的這項計劃，已經牽涉到許多人的利害關係，不僅英國的許多高官要員被納入計劃之中，以使其在西部土地投機買賣中獲利，而且北美殖民地尤其是弗吉尼亞的許多在對法、對印第安人的戰爭中服過役的軍隊官兵都等待得到一塊土地作為報酬。其中，華盛頓名下應得的就有32373英畝。此一計劃已欲罷不能。
1772年，支持和反對這一計劃的活動和較量進入最後階段。沃頓等人四出活動，爭取有關官員的支持；希爾斯伯羅在3月25日商務部考慮這一計劃時，又一次反對該計劃，並揚言若計劃獲准，他將辭職。身為愛爾蘭大土地所有者的希爾斯伯羅對北美洲西部領土的開發一直沒有興趣，他先前的一度表示支持完全沒有誠意，用他自己的話說是「以為財政部不會同意這項請求」。
終於，在6月5日的一次聽證會上，由富蘭克林、瓦爾普爾和賓夕法尼亞的商人代表以及弗吉尼亞的士兵代表陪同的沃頓進行了一場長時間的精彩的舌戰，贏得了聽證委員會的贊同。該委員會向王室樞密院提出了否決希爾斯伯羅反對意見的建議。大俄亥俄公司將被授予他們申請的土地。希爾斯伯羅辭職了。這個前殖民地事務大臣為此對富蘭克林耿耿於懷，因為他以為公司對他的反對報告提出的抗辯是出自富蘭克林的手筆。而實際上不是。他還不知道，他失敗的很大一部分原因是他在樞密院中的政敵起了作用。當時，他在英王眼中已不那麼重要了。達特茅斯勳爵繼任了該職。
至於富蘭克林自己，在經歷了這麼長的奮爭以後，突然感到厭倦，這個計劃對他來說是偶然進入他的生活的。1774年，他被英國內閣中傷並解職，他便放棄了在大俄亥俄公司的股份。在美國西部領土的開發上，他還參與了費城一些土地投機者有新斯科提亞建立21座城鎮的計劃。在那個計劃中，他有2千英畝土地的份額，可望獲利，儘管目前那計劃進展頗不順利。
－－待續
