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【大紀元11月5日報導】（中央社記者陳守國金門5日電）文昌魚是生物演化研究的重要物種之一，揭示脊椎動物的起源，因棲地被破壞，族群減少，金門縣水產試驗所在室內繁殖成功並保存。
文昌魚屬脊索動物門的頭索動物亞門，寒武紀地層中就發現文昌魚化石。文昌魚外觀形態在漫長的演化歷史並沒有明顯變化，因此有「活化石」之稱。
金門國家公園管理處在民國99年5月曾委託學者調查研究金門沿岸文昌魚生態，在金門西側與南側海域的料羅灣、金烈水道與小金門周遭海域規劃34個測站採集文昌魚，只在3個底質為中等佳到尚佳的粗砂環境測站中，有文昌魚捕獲的紀錄。
研究也發現，金門水域捕獲的文昌魚，分別是白氏文昌魚與日本文昌魚，這2種文昌魚的吻鰭、前臀鰭腔室、尾鰭形態不同。
文昌魚屬脊椎動物的魚類，體長3到5公分，成魚長5公分，壽命2年多。廣泛分布在各大洋低、中緯度海域的近岸淺水區。有位美國科學家曾發表文章，敘述廈門與金門間海域有大量的文昌魚棲息與漁民捕撈文昌魚的工具、生產活動。
近年大陸沿海經濟開發與環境變遷，破壞文昌魚棲地，文昌魚族群大量減少，因此中國大陸已將文昌魚列為國家二級保護動物。
廈門一水之隔的金門，因戰地政務限制沿岸的開發，自然環境未受太大的破壞，相對地保持許多野生動物棲地的完整性。近年來大陸漁民非法入侵大小金門海域採捕文昌魚及抽取海砂、沿岸開發造成污染，破壞金門海域文昌魚資源及棲地，族群減少。
