“基因组学X奖”新规则 比赛截止日延长

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【大纪元2011年11月02日讯】(大纪元记者万君编译报导)2006年,由梅德科提出的阿坎(Archon)“基因组学X奖”在加州普雷亚维斯塔成立,奖金为1,000万美元,希望鼓励经济、准确、快速地发展用于医疗目的的人类基因组测序(sequencing)。当时的目标是在10天之内每个少于10,000美元的代价破译100个人类基因序列。虽然八个组织最终签署了挑战,但是其实没有一个企图开始测序。

《科学杂志》报导,从那时起测序成本直线下降,人类基因组的测序成本在10,000美元左右。但10天截止的期限仍然是一个不可能完成的挑战。同时, 基金会和测序委员会从来没有真正制定出如何裁决奖金。因此,他们已经决定重新开始。

今天,在《自然遗传学期刊》的纽约市新闻发布会上,X奖基金会的楷德思和坎帕尼设计了修订后的挑战,其中包括不那么紧张的截止日期和其他一些变化。

根据新的规则,100个由基金会确定的百岁老人的基因组测序比赛将于2013年1月3日发枪开始。截止日将在2月3日而不是1月13日,但赢得全奖需要每个基因组的花费不超过1,000美元。参赛作品也将必须满足严格的准确性,即百万分之一的错误,以及98%的完整性。

马里兰州洛克维尔的J. Craig Venter研究所的计算生物学家格兰杰.萨顿说:“我认为,价格有可能实现,而且打破所有其他标准将是非常具有挑战性的。”

如果没有成功,只要在不同类别中的最低标准得以满足,裁判官仍将分类颁发较小的奖项。如果超过一组满足大奖的要求,那么获胜者将是第一个完成的。

楷德思表示,我们的目标是准确而又廉价地展示人类基因序列的组合是可能的,并且希望收集这些数据最终将在诊所成为常规检测。选择超过100个健康人为科学家提供数据,主办方也希望比赛将给长寿和健康的老龄化带来新的见解。

他还说,组织者和他们的顾问也花了近2年的时间通过邀请来自社团输入的方式, 发现了判断基因组测序的省钱办法。他们不会对已经提交的基因组进行彼此比较,而是通过比赛开始的时间,通过使用多种工艺已经完成25个基因组测序的一部分,并且用多种技术确保一个体系中每一个基准是正确的。然后,他们将提交的同纠正的序列进行比较。审计人员也将复查成本以确保每一分钱用到实处。但楷德思仍然继续从事测序工作来选出最终的规则。

基金会将与八个原参赛者联系,但楷德思预测,有些人会中途离开,因为曾经专著于DNA测序的一些公司今天已经转移了优先事项。萨顿说,原来说他们不感兴趣的组织,如Illumina公司,现在可能已是强大的竞争者。鉴于比赛将举行很久,“最有可能竞争的是那些已经调整现有技术的那些公司,”萨顿指出。话又说回来,“你永远不能肯定将会发生什么。”

(责任编辑:张东光)

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