基因諾亞方舟:測序物種增至6.6萬個

人氣 170

【大紀元2018年09月19日訊】(大紀元記者张妮編譯報導)一個由50個機構聯手的國際財團組建的基因諾亞方舟項目近期宣布,將蒐集物種的數量從原先目標的1萬增至6.6萬個。獲得基因序列將保存在開放的網絡平臺上供人類共享。

科技博客Gizmodo報導,G10K財團組織的基因諾亞方舟項目——脊椎基因工程(VGP),預計投資6億美元蒐集地球上6.6萬個脊椎動物品種的基因序列,包括所有哺乳動物、鳥類、爬行動物、兩棲動物和魚類。來自12個國家50個機構的150多位專業人員參與這一項目。

該項目原計畫蒐集至少1萬個脊椎動物品種的基因序列,但隨著基因序列技術的極大發展和成本的降低,G10K決定將蒐集的品種增至6.6萬,而且每個品種還分別蒐集雌雄兩個個體的樣本。

G10K財團上週在紐約洛克菲勒大學(Rockefeller University)舉行的2018基因組10K大會上宣布了項目的擴容。

會上還展示了代表著五大類脊椎動物的14個新蒐集的高質量基因序列,包括大馬蹄蝙蝠、加拿大山貓、鴨嘴獸、安娜蜂鳥、鴞鸚鵡(新西蘭一種不會飛的鸚鵡,大約僅存150隻)、沙漠龜、雙紋蚓螈(一種奇怪的無肢兩棲動物,長得像蛇)和攀鱸等。

G10K聯合創辦人之一、聖地亞哥動物園保護研究所的Oliver Ryer說,這個項目將幫助科學家了解物種滅絕、惡性突變、近親繁殖、遺傳瓶頸等問題的原因。

十年前G10K啟動之時,其成員完全不知道獲得高質量的基因序列做科研之用需要多長時間和多少開支。然而現在他們能夠:

● 著重使用長讀、非短讀測序來獲得高質量基因組。意即讓每個基因數據塊長一些,這樣只需數千個數據片段拼成一個基因組;若是短讀測序,則需要數百萬個數據片段。

● 不再把雌雄序列混合稱一個基因組,而是給雌雄體分別測序。

馬克斯普朗克分子細胞生物學和遺傳學研究所(Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics)的領銜研究員、VGP項目成員之一Gene Myers說,十年後的今天,平均每個脊椎物種測序只需不到一千美元,按照這個趨勢繼續發展,基因組領域的格局將發生極大變化。

要知道十年前,給一個動物測序就要數百萬美元和幾年的時間。

G10K召集人、國家人類基因組研究所(National Human Genome Research Institute)的Adam Phillippy說,新技術讓一項測序可在一週內完成;新物種首次測序耗資約三萬美元。

這個項目蒐集的所有基因序列將存在「基因組方舟數據庫」中,一個在線開放平臺上供科研界共享。◇

責任編輯:朱涵儒

相關新聞
美國繪製犬基因序列草圖 有利破解人類疾病
台灣完成紅麴菌基因序列草圖 發展潛力大
人類蛋白質組計劃試圖對基因序列圖解碼
科學家獲得雞的基因序列
最熱視頻
【新聞大家談】神祕泰山會解散 德州奇兵贏一局
【遠見快評】德州首勝拜登 川普早有遠見?
【時事縱橫】布林肯上任說啥 蓬佩奧備戰2024大選?
【秦鵬直播】德州受夠了?議員提獨立公投法案
【時事軍事】台海局勢緊張 美航母戰鬥群進南海
【重播】美國務卿布林肯首次媒體發布會
如果您有新聞線索或資料給大紀元,請進入安全投稿爆料平台
評論