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什么是基因组测序?为什么它很重要?

什么是基因组测序?为什么它很重要?图说:2020年2月19日,格拉斯哥皇家医院冠状病毒检测实验室,临床支持技术员从拭子样本中提取病毒,以便分析和确定病毒的遗传结构。(Jane Barlow - WPA Pool/Getty Images)
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【大纪元2020年08月19日讯】(大纪元记者代希新西兰编译报导)随着新西兰出现新的中共病毒集群,我们听到了更多关于基因组测序的事情。那麽它到底是什么,又是如何帮助我们战胜病毒的呢?

通过基因组测序,疫苗学家可以有针对性的研发疫苗,科学家也可以追溯病毒来源。

基因组学是什么?

我们已知人类的基因组由22对成对的染色体和第23对区分性别的染色体组成,由DNA双螺旋或脱氧核糖核酸组成,包含约30亿个堿基和约3万个基因。而中共病毒的基因组是由核糖核酸(RNA)组成的,所以它是单链的。它只有3万个堿基,包含15个特定的基因。

通过对病毒的整个基因组排序,科学家可以可视化病毒,并让疫苗学家找到它蛋白质结构的特定部分作为攻击目标。同时,对单个样本进行全序列测序可以理清疫情来源,直接将一个阳性病例与另一个城镇或国家的病例联系起来。

基因测序告诉了我们什么?

在最近一次疫情爆发之前,新西兰记录的中共病毒病例约有1200例,其中绝大多数为从海外返回的旅客。

在对2月至5月期间的大约一半的病例进行全测序后,科学家们能够梳理出277个单独的病毒序列。

这些序列中的大多数可以追溯到北美。

此外,他们还能够利用基因组数据来帮助了解我们第一次封锁的效果。例如,新西兰最大集群的有效繁殖数量,一个人的平均传播次数,以及在四级封锁的第一周从平均传播次数从7次缩减到0.2次等。

全新的病毒序列告诉了我们什么?

据报道,奥克兰Rydges酒店管理隔离设施的一名维修工人在8月11日开始咳嗽,而后在8月13日进行的拭子检查中得到了中共病毒阳性检测结果。这名男子与客人没有面对面的接触。然而,感染他的病毒的基因组与7月28日从美国前往新西兰的一名女子的基因组相符。这名女子在第三天的检测中被检测出呈阳性,并已于7月31日被送往隔离。

坎特伯雷大学的教授迈克尔•普朗克(Michael Plank)表示,基因测序指出了病毒传播来源于被污染的表面的可能性。“这凸显了对在边境或检疫设施工作的每个人进行定期检测的重要性。”普兰克说。

奥克兰大学微生物学副教授苏西·威尔斯(Siouxsie Wiles)说,最新的信息再次表明,在新西兰等国家,基因组测序在帮助确定潜在的传播源方面是多么重要,这些国家对疫情管理得都很好。

奥塔哥大学和ESR的进化病毒学家杰玛·盖根(Jemma Geoghegan)博士说,最近在南奥克兰爆发的疫情的起源尚不清楚,但它和新西兰以前的任何病例都没有关系。

她说:“我们能做的就是通过基因测序确认其是否会是一次疫情爆发。有了这些基因组数据,官员们在应对疫情时更有信心,因为通过追踪接触者,他们可以将奥克兰以外的少数病例与疫情集群联系起来。”

盖根说,她希望新西兰的每一个阳性病例都能被测序。“很明显,如果你确实了解基因组学,你可以在应对疫情未知来源时发挥极其重要的作用。”

责任编辑:蓝克

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