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【大纪元4月5日讯】自由时报记者许绍轩／特稿 台湾中科院转型行政法人只是挽救日渐萎缩研发能量的第一步，政府如果还是无法确立自主国防的界线而依循旧习大举外购，内部管理依然僵化，转型仅是治标，中科院前景依然堪虑。
高科技研发单位性质原本就与部队相差很多，军方长期以带部队方式管理中科院，引发许多反弹，更惹来研发人员“太多人靠嘴巴做事，只想当好人”的抱怨；也有中科院约聘雇人员不讳言，军中靠关系的恶习早已渗透，许多特殊关系的介入，让基层只好阳奉阴违才能推行工作。
研发人员很受不了被当成小兵管，一天到晚填不完的表格，像在营调查表、安全调查表、政治教学、保密切结书等。也发生过某计划管制室因前一个月的人事预算执行进度不佳，由所长带领副所长以下一、二级主管与研发人员进行花费计算，结果延误研发工作。
国防自主政策的摇摆不定打击更深，每年国防部花费上千亿元的预算在军事投资项目，分配给中科院不到二成，外购为主的建军政策，让中科院员工觉得大环境日渐萎缩，有前途茫茫之感。
与同样性质的工研院相比，中科院表现较弱，双方同样执行经济部科专计划，中科院平均专利获得与专利应用的成本都是工研院的三倍，但平均获得的授权与权利金却只有工研院的八成；显见中科院确实老态龙钟，再不改革恐将无以为继。
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