【大纪元5月4日报导】（中央社记者翁翠萍台北四日电）中央研究院研究团队在欧盟EGEE计划协助下，针对禽流感病毒蛋白的八种可能变异结构，挑选三十万个小分子药物的活性反应模拟测试，在四周内使用一百三十七个CPU年的电脑计算能量加以排序后，初步分析可能有效的药物出现在前百分之十三，筛检成效卓著，有助寻找治禽流感药物。
负责禽流感药物开发的中研院基因体研究中心博士吴盈达表示，流感型式多，人类只传染三种，鸟类常见的流感偶尔会传给人类，近年证实H5N1可传给人，累计近两百人感染，其中一百三十人死亡，致死率相当高，施用克流感等药物，又发现流感病毒蛋白会突变，中研院想从已知药物，在实验室设计药物使病毒蛋白发生作用，所以需要大量计算，欧盟的EGEEE平台协助做了快速筛选，有助加速了解病毒突变后那些药物仍然有效，也希望了解病毒蛋白在那里变种再从中着力。
他说明，有了全球网格基础架构（WLCG/EGEEe-Infrastructure）的超高计算能量协助，快速从三十万个药物结构排序找出较具信任度的近四万个药物结构，中研院可进一步用自己的算法，再找出大约两千个更可能有效的药物结构，加速新药开发，这第二阶段找出可能药物结构的信任度可提升为前百分之五。
这项禽流感药物设计的计算模拟，由中研院网格计算团队、基因体研究中心负责，与法国CorpuscularPhysics Laboratory of Clermont-Ferrand，CNRS/IN2P3、意大利Institute for BiomedicalTechnologies，CNR共同合作。由台湾与法国主导，串连EGEE、AuverGrid及中研院TWGrid三网格系统，在欧洲动员三千台电脑，使用大约一百三十七个CPU年的计算量，产生一千四百个GB（Giga Byte）的资料量。
中研院网格计算团队主持人林诚谦博士表示，这是目前全球最大的跨国药物设计计算合作案例。不仅证明WLCG/EGEE网格系统大幅提升了生物计算及资料分析的速度，也展现全球网格基础架构弹性，即整合全球网格资源与即时支援大规模计算的应变能力。
他进一步说明，如果只用一台电脑，前述计算能量须要一百三十七年来完成，但现在动员两、三千台电脑，就只需要三周半时间就可完成计算。
吴盈达则表示，如果没有这种超高计算能量，以过去保守做法，挑选一、两千个药物结构，用一台电脑，至少要一两年才可计算完成，若还找不到有效的药物结构，又再找一两千种可能的药物结构继续计算。有了全球网格基础架构协助，才可能针对立即的疾病，广面的取三十万个药物结构去计算预测，这在过去是无法想像的。
