自从失去了家国，天祥的身上就随时暗藏了一把匕首，以备在必要时自刎所用。当时元军占领了临安，但两淮、江南、闽广等地还未被元军完全控制和占领，天祥随时准备出逃，只要逃的掉，他誓为家国社稷的保全，再度竭智尽忠、死而后已。
当时（1276年）元军责令南宋朝廷派使去元都送投降书，另派一条囚船押送文天祥。这条囚船从大运河行驶到无锡附近，当地黄埠墩﹙是大运河中的一个小岛﹚的百姓得知文天祥在船上，各个抚岸痛哭，长跪囚船，并用石块投掷官船，痛骂南宋小朝廷认贼作父、为虎作伥。群情汹涌，感动了囚船上的文天祥，他痛哭失声，于是作诗一首，至于此诗至今还矗立在黄埠墩的一块巨大的石碑上呢。
就在押送天祥前往元朝京师大都（今北京）的路上，天祥一行人冒着极大的风险真的在镇江幸运脱身了；当时文天祥的船只虽马上被元军巡船发现，可是巡船追捕时却因为搁浅无法行动，眼睁睁的看着天祥的船渐行渐远，这天意要天祥自由，于是开始了他颠沛流离到处打游击战的苦战生涯。
文天祥一行人首先到达了真州（今江苏仪征市，即扬州市西南），在边境的真州军民的热情欢迎之下，真州的昔日同僚却认为天祥已是降元的奸细，要擒拿他就地正法，这边境的守将苗再成进退两难，只好忍心把文天祥骗到城外强驱离开。无奈何悲愤的天祥只好乘黑夜通过元军控制的地界，到达了扬州城下。然而此处的宋军已经明令要捉拿天祥，所以更是走投无路，盘查严密，形势紧张，他们流离无方，既要躲避元军，又要躲避宋军。文天祥于是决定离开扬州，去寻找更南方的二王行在﹙即益王赵罡和卫王赵昺﹚，再为朝廷效力。
从扬州到高邮，文天祥一路颠沛流离，饥寒交迫。说巧不巧，当他们走到桂公塘（距扬州约十五里的小村庄）时，竟然又遇上了当时押解他们的元兵队伍的搜寻。幸好天上突然狂风大作，乌云密布，元军急着躲雨，当时匆匆而过，竟然没能发现眼前就在路边伏着的他们；才侥幸逃脱，好不容易到了高邮，随从已是逃的逃、死的死，十二人只剩下六个。身心俱疲的天祥因连日疾行双腿已伤，他咬牙力撑靠一群樵夫挑担子帮助，才勉强到达高邮的。谁知高邮方面的这些守军完全中了元军的反间计，无奈何的天祥还是无法进城，只得再向泰州（今江苏泰州﹚摸索前进。经过这样沿路元军出没，宋军抓补，还有强盗抢劫的历程，德祐二年（1276年）闰三月，九死一生的他终于经过了这两三个月日夜惊惧、不成人形的逃亡，扬帆入海，回到了南宋最后占据的地方。
同年景炎元年（1276）五月他辗转到达了福州，希望能够挽狂澜于既倒。端宗仍然拜文天祥为丞相，督师江西。当月端宗﹙即益王赵罡﹚在福州登位，延续国祚，文天祥此时担任枢密使兼都督诸路军马。可是张世杰这个人开始专制朝政，至于前任宰相陈宜中这个人也还在南宋行朝之中左右时局，所以天祥为争取时效，只好自己以同都督的身份在南剑州（治今福建南平）开府，指挥抗元。
七月，文天祥在南剑州（今福建南平）开督府高举义旗，招募义军，以图复兴，因天祥忠坚声望不坠，很快又组成了一支督府军。但是，流浪王朝里的朝臣还是异议不断，隐患迭现。十月，文天祥开始出兵汀州（今福建长汀），可叹天祥受任于如此败军之际，奉命于如此危难之间，无论他如何夙夜忧勤，还是战斗失利。在元军的强势攻击下，最后保家卫国的南剑州也落入了敌手，行都福安（即福州）也随即陷落，南宋小朝廷从此成为海上的流亡政府，名存实亡的南宋眼看已是名实俱亡！@
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