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藏醫臟腑病學又稱《藏醫內科病學》之二，根據其內容也可稱藏醫內臟疾病學之二，它是藏醫學關於軀體內部或臟腑本身疾病的重要臨床學科之一，具有很多獨到的理論觀點和藏醫自身的特色。
藏醫學認為，人體內有五臟六腑。五臟指心臟、肺臟、肝臟、脾臟、腎臟；六腑指小腸、胃、膽、膀胱和三木休，主指男性的精囊和女性的卵巢。在《四部醫典》的第三部《藏醫臨床技能學》中就有系統論述，共有八章的內容。
第一章是關於心臟病症類的治療，講述了心臟的７種大的疾病的病因、診斷和治療等理論和臨床技能知識；第二章是關於肺病症類的治療，講述了肺臟的８種疾病的病因、診斷和治療等理論和臨床技能知識；第三章講述了１８種肝臟病的病因、診斷和治療等理論和臨床技能知識；第四章講述了脾臟５種病的診治；第五章講述了腎臟８種病的診治；第六章講述了胃８種病的診治；第七章講述了小腸５種疾病的診治；第八章講述了大腸５種病的診治。
以上這些疾病的分類中不包括其他章節裡所涉及的相關疾病的診治等。
